科學(xué)家發(fā)布 版本的人類蛋白質(zhì)圖譜 或?qū)⒊蔀檫M(jìn)行代謝模型研究的基礎(chǔ)
時(shí)間：2016-04-18 13:52 來(lái)源：川北在線整理 責(zé)任編輯：沫朵
原標(biāo)題：科學(xué)家發(fā)布 版本的人類蛋白質(zhì)圖譜 或?qū)⒊蔀檫M(jìn)行代謝模型研究的基礎(chǔ)
近日，刊登在國(guó)際雜志Molecular Systems Biology上的一項(xiàng)研究報(bào)告中，來(lái)自查爾姆斯理工大學(xué)的研究人員通過(guò)研究發(fā)布了第15版的人類蛋白質(zhì)圖譜(Human Protein Atlas)，新版本中包括了來(lái)自不同數(shù)據(jù)來(lái)源的大量研究數(shù)據(jù)，為后期對(duì)比不同組織樣本之間的RNA和蛋白質(zhì)水平提供了新的思路和研究基礎(chǔ)。
深入揭示人類組織或細(xì)胞的健康和疾病狀況或可幫助科學(xué)家們更好地闡明疾病發(fā)生的特殊機(jī)制，而進(jìn)行相關(guān)的對(duì)比，研究者們首先就需要知曉我們?nèi)祟悪C(jī)體的構(gòu)成，其中一個(gè)方法就是分析轉(zhuǎn)錄組，這意味著要深入發(fā)現(xiàn)哪些組織或細(xì)胞樣本中的哪些基因是被激活來(lái)產(chǎn)生蛋白質(zhì)的。
人類的蛋白質(zhì)圖譜計(jì)劃包括對(duì)靶向超過(guò)1.7萬(wàn)個(gè)特殊蛋白的2.5萬(wàn)多個(gè)抗體進(jìn)行蛋白質(zhì)組的分析，同時(shí)還結(jié)合對(duì)2萬(wàn)個(gè)蛋白編碼基因的轉(zhuǎn)錄組學(xué)進(jìn)行分析；而研究者在4月11日發(fā)布的人類蛋白質(zhì)圖譜新版本中則包括多個(gè)數(shù)據(jù)來(lái)源中心的原始數(shù)據(jù)，其就為后期從事比較性的研究提供了研究數(shù)據(jù)；新版本的蛋白質(zhì)圖譜對(duì)不同的人類組織的轉(zhuǎn)錄組進(jìn)行了圖譜的繪制，相比此前版本這是一項(xiàng)巨大的進(jìn)步，而且這些數(shù)據(jù)或?qū)⒊蔀檫M(jìn)行后期代謝模型研究的基礎(chǔ)。
文章中，研究者描述了新型的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)資源，他們重點(diǎn)對(duì)比了來(lái)自博德研究所、波士頓、GTEx等機(jī)構(gòu)的研究數(shù)據(jù)庫(kù)；GTEx數(shù)據(jù)庫(kù)中包含了超過(guò)1600個(gè)樣本，對(duì)其中28個(gè)樣本進(jìn)行RNA測(cè)序研究，同時(shí)將研究結(jié)果同人類蛋白質(zhì)組圖譜進(jìn)行一致性對(duì)比或許就可以幫助科學(xué)家們對(duì)比人類蛋白質(zhì)組圖譜和GTEx數(shù)據(jù)庫(kù)之間的差異和關(guān)聯(lián)。
同時(shí)研究者還在文章中討論了公開的人類轉(zhuǎn)錄組資源以及這些數(shù)據(jù)庫(kù)的多方面應(yīng)用價(jià)值，比如構(gòu)建基因組尺度的代謝模型用來(lái)分析健康和疾病個(gè)體機(jī)體中的細(xì)胞和組織的功能；后期研究人員還將通過(guò)更為深入的研究來(lái)利用新版本的人類蛋白質(zhì)組圖譜來(lái)對(duì)人類多種疾病的發(fā)病機(jī)制進(jìn)行剖析和研究。
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